Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Nicotiana tabacum

CDS Sequence

CDS ID

lcl|NW_015931416.1_cds_XP_016478247.1_69906

CDS Infomation

[gene=LOC107799619] [db_xref=GeneID:107799619] [protein=putative disease resistance RPP13-like protein 1] [protein_id=XP_016478247.1] [location=71436..75503] [gbkey=CDS]

Sequence

ATGGCTGTAGCAGAGGTGTTTCTTTCAGCATTCATCACTGTGTTGTTTGAGAAGTTAGCT
TCTGGGGAGATTTTGAACTTTGCAAGAAAAGAAGGAATCCAGTTTCAGCTCAAGAAATGG
AGCAGAACATTGTCCAAGATTCTGGCAGCGCTTGCTGATGCTGAAGAGAAGCAAATCACT
GATAAAGCTGTGAAATTGTGGCTAGAAGATCTCAGGGACTTGGCTTATGACTTGGATGAT
GTTCTTGATGAGGTTTCCACAGAGATTTTCCGGCGCAAAATGATGACAGAATTTAATTCC
AAGAGAAGTAAGTTACAAAAACTGATCCCTACTTGCTGTACCAGTTTGACTCCTAGTACT
TTGAAGTTTAACCATACTTTAGAGTCCAAGCTAGGGAAGATCAACTCTAGATTACTAGAG
ATGGCACAGCAGAAAATTGATTTAGGCTTGAGTGAAAATAATGGAGGGAGGTTTAGTTTT
ATTAGAATGAGAGAACGGATGCCTACAACTTCCTTAGTGGATGAATCTAGAGTTTATGGC
CGTGAAAAGGATAAGCATGCCATTCTTGATTTATTGCTGAGTAATCAGGGAAATTGTGAT
TTTGAAGCTTGCATCATTCCAATTGTTGGAATGGGTGGTGTTGGCAAGACAACCCTTGCT
CAACTTGCATACAATGATGCCAAAATTAATGATTGCTTCGATTTGAAGATTTGGGTCTGT
GTTTCTGAAGTTTTTGATGTATTGGGCATAACCAACTTGATTTTTGAGTCTGTGGCACCC
GAAAGTAGAGAGATTAAGGGCTTGGATATGCTTCAAGTAAGTTTAAAGGAGAAGCTTTCG
AAGAACAGGTTTCTTCTTGTACTTGATGATGTATGGAATGAGAATTACGGAATGTGGGAT
CTCCTTCTGAGTCCCTTGCGAGTTGGACTGCCTGGAAGTAAAATTGTTGTCACGACGCGC
AATGAGGGTGTTGCATCTGTTATGAGTTCTGTTACTCCTTATCGATTGAAGGAGTTAGCA
AGTAGTGATTGCCTATCATTATTCTGTCAGCATGCTTTGGGTTCAATAAATTTTGATGCA
CAGCCGGACTTGAGGATGATTGGTGAGAGATTGGTGAAAAAATGTAAAGGCTTGCCTTTG
GCTGCAAAGACTCTTGGTGGTCTCTTGCGAACAAAATCAAGGCCAAAGGAGTGGGAAGAT
ATACTAAATAGCAAGATATGGGATTTACCTGAAGAAAAAAGTGACATTCTTCCTGTTTTA
CGGTTGAGCTATTATCATCTCCCTTCTGATTTGAAGCCCTTGTTTGCATACTGCTCAATA
TTTCCGAAGGATTATGAGTTTGACAAGGACGAGCTTATTTTGTTGTGGATGGGGGAAGGA
TTCTTGCAGCAATCAGAAGGAAAGAAAATACTTGAAGAATTGGGTGATGAATGCTTTAAT
GAGCTGTTATCGAGGTCATTTTTCCAACATTCTAGTGGTAATGAATCAAGATTCATGATG
CATGATTTAATACATGATTTAGCCGAGTTTGTTGCTGGAGACATATGCTTTAGGTTGGAT
GAAAGATCAGAGGGTACACAAAGGACAACAAATTGTCAGAAGGCGAGACATTCATCTTAT
GTTCGTCGGCAGTATGAAATTTTTAAAAGGTTCAGTTCCCTCCATGCCGTTCAAGGTCTA
AGGACATTTTTACCCTTAGAGGTTCAGAAGTTAGAAGGTTGGCAGAAGTCCTACATATCA
AAAGGCTTATTGGATTTCCTACCTAAACTACGTTCCTTGAGAATTCTGTCATTAAGTGGA
TATTGCATAGCTGAGCTACCAAACTCCGTTGGTGATTTGATACATTTGCGCTTCCTTGAC
TTATCGGAGACATCAATTAAGCAGCTACCAGAATCAATTTGTTCTCTCTATAATCTACAG
TCCCTTTTGCTGTGTGGTTGCTACAGACTCACTAAGTTGCCAGCAACATTAGGAAATCTA
ATCAACCTCAGACATCTTAATAATGCTGACACCGAGCAATTACAAGAGATGCCCACAGGA
ATCTATAAGTTGACAAGTCTGCAGACTCTCCACAAAATGGTATTAGGCAGAAGTAATAGC
TTGAAACTGTGGGAGCTAAAAAGCCTGTCGAATCTCCATGGAACACTTGCCATTACGGAG
TTGCAGAGTGTCACTGATACTACAGATGCAAGGGAAGCTGATTTAGCTTCTAAAAAAGGC
ATTGATGAGTTGGTGATGGAATTCAACAAAGATTTTGATGGTTCAAGGGATGCAAGACTT
GAAAAGGATGTTCTTGAACTATTACAACCTCATGGGAACTTGGGAAGACTCAGTATACTG
TTTTATGGGGGAATAGAATATCCAAGTTGGATAAGCCCGGGCTTGCTTAAAAGCTTAACT
CATTTGACATTAGGTGGTTGTAGAAGCTTCACCTTGCCAACACTTGGGCAGCTGCCGCTT
CTTGCAGAATTGTATGTTCATGACATGCCATGTGTGAAAAGGGTAGGTACTGAGTTTTGT
GGAGGTGATGATCCCTTAAATTTGGGTTTTCCAGCACTGGAAGTTCTGAGGTTTGAAAAC
TTGCCGGAATGGGAGGAATGGTACATTTCGCTCAGCAATGCGTTTCCTCGACTCCATGAG
CTTAGCATATGTAATTGTCCCAAATTGAGTGTTGTTTCTCTCTCTAATTTTCCAGTACTT
CGTGAGCTGAATTTAGATGAATGTAACGTGCAAGTCCTTAGAAGCATTTTTGGCATCTTT
TCCGTAAAGGTCCTGAAAATTCGCTGTGTTTGGGGACTCAGTCTACTATCTAAAGAGTTA
ACACAGTATCTGGGGTCACTTGAAGATTTGGATATAACTGAGTGTGGGGATCTGATATCA
CTGTGGGATGGTAAATCTTCAATAGAACATCTCAGTAATCTGAAAAATCTGGGAATTTCT
AAGTGTCCCCAACTGAAGTGCTTGTCACTAGAAGAGAATGCATTGCCTCAGACACCTGAA
TCTTTGTCCATATGTGAGTGCTCTAATTTTGAGAATCTTCCCTGTGGATTTGACAACGCA
TTATCTCTCAGACAGTTGCGCATCAGATCATGCCCGAAAATTGTCTCACTTGATGTTGCT
GAGCTATCTACCATGCTTAAACGAGTTGAAATTGCACATTGTGTGGCTTTGGAGACCTTG
CCTCATCGGAGCCATTGTCTTGAGGAGCTCAAGATTGACGGCTGCCCATCACTCAGATCC
ATTTCAACTCACAGACTGCCAACTACTCTTAAGGTACTCCAAATTGATAATTGTAGGGAG
CTCGCTTCAGTTTCAGATACATTGCTGCAGGGAAGCAGTAGTTTCGAACGTCTCAGGATT
TCTAATTGGCCAAGTTTCACCGTGTTACTGAGATCTGTAGAAAGAATGCCAACTTTATTT
TCATGTCTTGTCGAATTGCACATAAGTCGTTGTGATACTCTAGAGTCTTTCCCACATGGT
TGCTTGCCTTCCCATAATCTGAGAAGCCTTTCAATCTGGAGCTGCAGCAATCTCCACAAA
CTGCCTGATCAGATTGGAGGCCTTACATCACTTGAGTCCCTGATGCTACATGATTGTACC
AGTCTCGAGTCATTTCCTGAGCAGGAGTTGCCTCCCAACTTAACTTCACTTTGGGCCAGC
AGCTGTCACACACTCAAACCTCTATCAGAATGGGGTCTGCACAAGCTCACCACTCTCCAA
AAGTTGACAGTCATTGATGGATTCATGGATCTCGTTTCATTTCCCGATGATTGCGTGCTT
CCATCCAGTTTAACCTCACTTTGGCTTGGTAGACTCTGCAATCTTGAATCTCTTTCCAAG
GGACTCGTAAATCTGTCTTCTCTAGAGCATCTGCTAATAAGGGACTGCGCCAAGCTTCGT
CACTTGCCTAATCAAGAGTTGCTTGATACAATCTCATATCTGGAAATTCGAGGCTCGCCA
CTTCTAAAAGAAAAGTGCTTGAAGGAGAAAGGAGAATACTGGTTGAAGATAGCAAACATT
CCGTGCGTACATATTGACGGTACTCTGCTTCATGAACAAAATTCATAG

Peptide Sequence

PEP ID

XP_016478247.1

PEP Infomation

PREDICTED: putative disease resistance RPP13-like protein 1 [Nicotiana tabacum]

Sequence

MAVAEVFLSAFITVLFEKLASGEILNFARKEGIQFQLKKWSRTLSKILAALADAEEKQIT
DKAVKLWLEDLRDLAYDLDDVLDEVSTEIFRRKMMTEFNSKRSKLQKLIPTCCTSLTPST
LKFNHTLESKLGKINSRLLEMAQQKIDLGLSENNGGRFSFIRMRERMPTTSLVDESRVYG
REKDKHAILDLLLSNQGNCDFEACIIPIVGMGGVGKTTLAQLAYNDAKINDCFDLKIWVC
VSEVFDVLGITNLIFESVAPESREIKGLDMLQVSLKEKLSKNRFLLVLDDVWNENYGMWD
LLLSPLRVGLPGSKIVVTTRNEGVASVMSSVTPYRLKELASSDCLSLFCQHALGSINFDA
QPDLRMIGERLVKKCKGLPLAAKTLGGLLRTKSRPKEWEDILNSKIWDLPEEKSDILPVL
RLSYYHLPSDLKPLFAYCSIFPKDYEFDKDELILLWMGEGFLQQSEGKKILEELGDECFN
ELLSRSFFQHSSGNESRFMMHDLIHDLAEFVAGDICFRLDERSEGTQRTTNCQKARHSSY
VRRQYEIFKRFSSLHAVQGLRTFLPLEVQKLEGWQKSYISKGLLDFLPKLRSLRILSLSG
YCIAELPNSVGDLIHLRFLDLSETSIKQLPESICSLYNLQSLLLCGCYRLTKLPATLGNL
INLRHLNNADTEQLQEMPTGIYKLTSLQTLHKMVLGRSNSLKLWELKSLSNLHGTLAITE
LQSVTDTTDAREADLASKKGIDELVMEFNKDFDGSRDARLEKDVLELLQPHGNLGRLSIL
FYGGIEYPSWISPGLLKSLTHLTLGGCRSFTLPTLGQLPLLAELYVHDMPCVKRVGTEFC
GGDDPLNLGFPALEVLRFENLPEWEEWYISLSNAFPRLHELSICNCPKLSVVSLSNFPVL
RELNLDECNVQVLRSIFGIFSVKVLKIRCVWGLSLLSKELTQYLGSLEDLDITECGDLIS
LWDGKSSIEHLSNLKNLGISKCPQLKCLSLEENALPQTPESLSICECSNFENLPCGFDNA
LSLRQLRIRSCPKIVSLDVAELSTMLKRVEIAHCVALETLPHRSHCLEELKIDGCPSLRS
ISTHRLPTTLKVLQIDNCRELASVSDTLLQGSSSFERLRISNWPSFTVLLRSVERMPTLF
SCLVELHISRCDTLESFPHGCLPSHNLRSLSIWSCSNLHKLPDQIGGLTSLESLMLHDCT
SLESFPEQELPPNLTSLWASSCHTLKPLSEWGLHKLTTLQKLTVIDGFMDLVSFPDDCVL
PSSLTSLWLGRLCNLESLSKGLVNLSSLEHLLIRDCAKLRHLPNQELLDTISYLEIRGSP
LLKEKCLKEKGEYWLKIANIPCVHIDGTLLHEQNS

Transcript Sequence

Gene sequence data has not been registered.